Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVFC1-1P60608 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFC1-1P60608 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFC1-1P60608 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms