Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EIF3EP60228 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EIF3EP60228 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EIF3EP60228 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms