Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN2P57739 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN2P57739 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN2P57739 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms