Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLE2P56282 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLE2P56282 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE2P56282 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE2P56282 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE2P56282 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE2P56282 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE2P56282 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE2P56282 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE2P56282 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE2P56282 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE2P56282 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE2P56282 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLE2P56282 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE2P56282 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE2P56282 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE2P56282 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE2P56282 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE2P56282 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLE2P56282 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE2P56282 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE2P56282 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE2P56282 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE2P56282 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE2P56282 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE2P56282 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE2P56282 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLE2P56282 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLE2P56282 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE2P56282 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE2P56282 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLE2P56282 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE2P56282 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE2P56282 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE2P56282 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE2P56282 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE2P56282 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE2P56282 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE2P56282 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLE2P56282 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE2P56282 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE2P56282 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE2P56282 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE2P56282 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE2P56282 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE2P56282 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE2P56282 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLE2P56282 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLE2P56282 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE2P56282 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE2P56282 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLE2P56282 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLE2P56282 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLE2P56282 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE2P56282 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE2P56282 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE2P56282 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE2P56282 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE2P56282 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLE2P56282 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms