Protein–RNA interactions for Protein: P55273

CDKN2D, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2DP55273 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDKN2DP55273 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKN2DP55273 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2DP55273 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms