Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN5P54829 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN5P54829 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN5P54829 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms