Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2KP53803 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2KP53803 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms