Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF138P52744 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF138P52744 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms