Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2JP52435 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2JP52435 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2JP52435 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms