Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAMP7P51809 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VAMP7P51809 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAMP7P51809 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAMP7P51809 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms