Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCN2P51788 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCN2P51788 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms