Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP4BP51164 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP4BP51164 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms