Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATMP50440 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GATMP50440 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GATMP50440 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GATMP50440 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GATMP50440 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GATMP50440 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GATMP50440 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GATMP50440 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATMP50440 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATMP50440 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GATMP50440 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATMP50440 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATMP50440 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATMP50440 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATMP50440 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATMP50440 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATMP50440 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATMP50440 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATMP50440 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATMP50440 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATMP50440 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATMP50440 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GATMP50440 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GATMP50440 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATMP50440 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATMP50440 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATMP50440 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATMP50440 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATMP50440 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATMP50440 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATMP50440 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATMP50440 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATMP50440 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATMP50440 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATMP50440 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATMP50440 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATMP50440 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATMP50440 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GATMP50440 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GATMP50440 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATMP50440 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATMP50440 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATMP50440 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GATMP50440 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATMP50440 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GATMP50440 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATMP50440 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATMP50440 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATMP50440 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATMP50440 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATMP50440 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATMP50440 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATMP50440 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATMP50440 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATMP50440 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATMP50440 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATMP50440 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATMP50440 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATMP50440 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GATMP50440 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATMP50440 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATMP50440 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATMP50440 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATMP50440 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GATMP50440 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATMP50440 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATMP50440 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATMP50440 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATMP50440 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATMP50440 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATMP50440 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATMP50440 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATMP50440 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATMP50440 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATMP50440 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms