Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IDH3AP50213 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IDH3AP50213 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IDH3AP50213 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms