Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP4P49662 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP4P49662 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP4P49662 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP4P49662 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP4P49662 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP4P49662 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP4P49662 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP4P49662 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP4P49662 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP4P49662 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP4P49662 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP4P49662 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP4P49662 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP4P49662 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP4P49662 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP4P49662 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP4P49662 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP4P49662 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP4P49662 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP4P49662 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP4P49662 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP4P49662 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP4P49662 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP4P49662 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP4P49662 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP4P49662 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP4P49662 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP4P49662 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP4P49662 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP4P49662 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP4P49662 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP4P49662 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP4P49662 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP4P49662 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP4P49662 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP4P49662 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP4P49662 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP4P49662 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP4P49662 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP4P49662 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP4P49662 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP4P49662 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP4P49662 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP4P49662 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP4P49662 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP4P49662 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP4P49662 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP4P49662 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP4P49662 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP4P49662 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASP4P49662 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP4P49662 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP4P49662 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP4P49662 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP4P49662 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP4P49662 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP4P49662 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP4P49662 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP4P49662 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP4P49662 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP4P49662 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP4P49662 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP4P49662 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP4P49662 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP4P49662 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP4P49662 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP4P49662 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP4P49662 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP4P49662 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP4P49662 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP4P49662 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP4P49662 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP4P49662 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP4P49662 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP4P49662 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP4P49662 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP4P49662 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP4P49662 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP4P49662 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP4P49662 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP4P49662 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP4P49662 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP4P49662 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP4P49662 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP4P49662 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP4P49662 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP4P49662 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP4P49662 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP4P49662 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP4P49662 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP4P49662 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP4P49662 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP4P49662 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP4P49662 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP4P49662 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP4P49662 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP4P49662 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP4P49662 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP4P49662 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms