Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LMAN1P49257 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN1P49257 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms