Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMTP48728 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMTP48728 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMTP48728 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMTP48728 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMTP48728 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMTP48728 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMTP48728 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMTP48728 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMTP48728 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMTP48728 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMTP48728 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AMTP48728 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMTP48728 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMTP48728 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMTP48728 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMTP48728 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMTP48728 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMTP48728 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMTP48728 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMTP48728 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMTP48728 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AMTP48728 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AMTP48728 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AMTP48728 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AMTP48728 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMTP48728 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMTP48728 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMTP48728 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMTP48728 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AMTP48728 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMTP48728 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMTP48728 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMTP48728 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMTP48728 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMTP48728 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMTP48728 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMTP48728 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMTP48728 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMTP48728 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMTP48728 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AMTP48728 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AMTP48728 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMTP48728 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMTP48728 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMTP48728 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMTP48728 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMTP48728 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMTP48728 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AMTP48728 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMTP48728 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMTP48728 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMTP48728 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMTP48728 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMTP48728 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMTP48728 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMTP48728 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMTP48728 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMTP48728 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMTP48728 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMTP48728 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMTP48728 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AMTP48728 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AMTP48728 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms