Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLMP48507 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLMP48507 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLMP48507 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLMP48507 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLMP48507 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLMP48507 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLMP48507 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLMP48507 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLMP48507 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLMP48507 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLMP48507 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLMP48507 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLMP48507 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLMP48507 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLMP48507 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLMP48507 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLMP48507 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GCLMP48507 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCLMP48507 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCLMP48507 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCLMP48507 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCLMP48507 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLMP48507 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLMP48507 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLMP48507 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLMP48507 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLMP48507 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLMP48507 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLMP48507 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLMP48507 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLMP48507 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLMP48507 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCLMP48507 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCLMP48507 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLMP48507 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLMP48507 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLMP48507 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLMP48507 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLMP48507 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLMP48507 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLMP48507 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLMP48507 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLMP48507 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLMP48507 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLMP48507 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLMP48507 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLMP48507 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLMP48507 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLMP48507 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLMP48507 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLMP48507 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLMP48507 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLMP48507 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLMP48507 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLMP48507 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLMP48507 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLMP48507 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLMP48507 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLMP48507 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLMP48507 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLMP48507 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLMP48507 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLMP48507 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLMP48507 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLMP48507 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLMP48507 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLMP48507 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLMP48507 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLMP48507 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLMP48507 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLMP48507 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLMP48507 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLMP48507 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLMP48507 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLMP48507 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLMP48507 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLMP48507 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLMP48507 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLMP48507 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLMP48507 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLMP48507 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLMP48507 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLMP48507 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLMP48507 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLMP48507 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLMP48507 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLMP48507 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLMP48507 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLMP48507 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLMP48507 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLMP48507 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLMP48507 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCLMP48507 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GCLMP48507 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCLMP48507 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GCLMP48507 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GCLMP48507 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GCLMP48507 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GCLMP48507 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms