Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCLCP48506 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCLCP48506 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCLCP48506 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCLCP48506 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GCLCP48506 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLCP48506 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLCP48506 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLCP48506 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLCP48506 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLCP48506 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLCP48506 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GCLCP48506 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLCP48506 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLCP48506 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLCP48506 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLCP48506 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLCP48506 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLCP48506 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLCP48506 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLCP48506 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCLCP48506 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLCP48506 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLCP48506 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLCP48506 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLCP48506 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLCP48506 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLCP48506 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCLCP48506 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLCP48506 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLCP48506 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLCP48506 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLCP48506 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLCP48506 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLCP48506 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLCP48506 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLCP48506 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLCP48506 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLCP48506 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCLCP48506 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCLCP48506 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCLCP48506 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCLCP48506 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCLCP48506 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCLCP48506 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCLCP48506 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCLCP48506 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCLCP48506 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GCLCP48506 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCLCP48506 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCLCP48506 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GCLCP48506 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLCP48506 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLCP48506 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLCP48506 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLCP48506 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLCP48506 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLCP48506 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLCP48506 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLCP48506 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLCP48506 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCLCP48506 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLCP48506 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLCP48506 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLCP48506 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLCP48506 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLCP48506 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLCP48506 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLCP48506 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCLCP48506 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLCP48506 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLCP48506 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLCP48506 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLCP48506 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLCP48506 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLCP48506 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLCP48506 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCLCP48506 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCLCP48506 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCLCP48506 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCLCP48506 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCLCP48506 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCLCP48506 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCLCP48506 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCLCP48506 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCLCP48506 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCLCP48506 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCLCP48506 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCLCP48506 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCLCP48506 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCLCP48506 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLCP48506 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLCP48506 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLCP48506 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLCP48506 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLCP48506 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLCP48506 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLCP48506 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLCP48506 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCLCP48506 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms