Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GALR1P47211 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GALR1P47211 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GALR1P47211 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GALR1P47211 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GALR1P47211 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GALR1P47211 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GALR1P47211 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GALR1P47211 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GALR1P47211 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GALR1P47211 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GALR1P47211 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GALR1P47211 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GALR1P47211 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GALR1P47211 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GALR1P47211 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GALR1P47211 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GALR1P47211 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GALR1P47211 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GALR1P47211 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GALR1P47211 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GALR1P47211 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GALR1P47211 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GALR1P47211 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GALR1P47211 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GALR1P47211 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GALR1P47211 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GALR1P47211 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GALR1P47211 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GALR1P47211 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GALR1P47211 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GALR1P47211 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GALR1P47211 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GALR1P47211 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GALR1P47211 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GALR1P47211 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GALR1P47211 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GALR1P47211 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GALR1P47211 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GALR1P47211 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GALR1P47211 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GALR1P47211 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GALR1P47211 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GALR1P47211 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GALR1P47211 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GALR1P47211 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GALR1P47211 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GALR1P47211 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GALR1P47211 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GALR1P47211 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GALR1P47211 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GALR1P47211 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GALR1P47211 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GALR1P47211 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GALR1P47211 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GALR1P47211 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms