Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF4P43489 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF4P43489 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms