Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP3P42574 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP3P42574 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP3P42574 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP3P42574 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP3P42574 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP3P42574 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP3P42574 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP3P42574 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP3P42574 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP3P42574 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP3P42574 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP3P42574 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP3P42574 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP3P42574 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP3P42574 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP3P42574 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP3P42574 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP3P42574 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP3P42574 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP3P42574 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP3P42574 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP3P42574 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP3P42574 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP3P42574 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP3P42574 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP3P42574 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP3P42574 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP3P42574 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP3P42574 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP3P42574 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP3P42574 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP3P42574 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP3P42574 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP3P42574 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP3P42574 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP3P42574 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP3P42574 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP3P42574 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP3P42574 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP3P42574 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP3P42574 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP3P42574 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP3P42574 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP3P42574 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP3P42574 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP3P42574 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP3P42574 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP3P42574 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP3P42574 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP3P42574 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP3P42574 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP3P42574 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP3P42574 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP3P42574 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP3P42574 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP3P42574 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP3P42574 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP3P42574 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP3P42574 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP3P42574 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP3P42574 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP3P42574 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP3P42574 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP3P42574 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP3P42574 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP3P42574 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP3P42574 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP3P42574 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP3P42574 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP3P42574 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP3P42574 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP3P42574 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP3P42574 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP3P42574 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP3P42574 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP3P42574 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms