Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CBP42338 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PIK3CBP42338 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CBP42338 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms