Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC19A1P41440 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC19A1P41440 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC19A1P41440 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms