Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH1P40692 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH1P40692 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH1P40692 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH1P40692 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH1P40692 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH1P40692 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH1P40692 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MLH1P40692 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH1P40692 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH1P40692 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH1P40692 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH1P40692 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH1P40692 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH1P40692 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH1P40692 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MLH1P40692 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MLH1P40692 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH1P40692 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH1P40692 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH1P40692 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH1P40692 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH1P40692 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH1P40692 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH1P40692 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH1P40692 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MLH1P40692 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH1P40692 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH1P40692 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH1P40692 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH1P40692 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH1P40692 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH1P40692 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH1P40692 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MLH1P40692 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MLH1P40692 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MLH1P40692 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MLH1P40692 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MLH1P40692 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MLH1P40692 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MLH1P40692 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MLH1P40692 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MLH1P40692 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MLH1P40692 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MLH1P40692 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MLH1P40692 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MLH1P40692 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MLH1P40692 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MLH1P40692 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MLH1P40692 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MLH1P40692 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MLH1P40692 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MLH1P40692 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MLH1P40692 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MLH1P40692 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MLH1P40692 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MLH1P40692 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MLH1P40692 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MLH1P40692 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MLH1P40692 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MLH1P40692 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MLH1P40692 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MLH1P40692 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH1P40692 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH1P40692 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH1P40692 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH1P40692 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH1P40692 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH1P40692 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH1P40692 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MLH1P40692 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH1P40692 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH1P40692 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH1P40692 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MLH1P40692 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms