Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGCXP38435 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGCXP38435 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGCXP38435 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGCXP38435 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGCXP38435 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGCXP38435 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGCXP38435 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGCXP38435 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGCXP38435 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGCXP38435 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGCXP38435 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGCXP38435 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGCXP38435 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGCXP38435 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGCXP38435 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGCXP38435 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGCXP38435 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGCXP38435 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGCXP38435 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGCXP38435 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GGCXP38435 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGCXP38435 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGCXP38435 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGCXP38435 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGCXP38435 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGCXP38435 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGCXP38435 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGCXP38435 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGCXP38435 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGCXP38435 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGCXP38435 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGCXP38435 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGCXP38435 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGCXP38435 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGCXP38435 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGCXP38435 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGCXP38435 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGCXP38435 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GGCXP38435 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GGCXP38435 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GGCXP38435 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GGCXP38435 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GGCXP38435 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGCXP38435 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGCXP38435 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGCXP38435 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGCXP38435 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGCXP38435 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGCXP38435 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGCXP38435 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGCXP38435 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGCXP38435 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGCXP38435 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGCXP38435 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGCXP38435 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGCXP38435 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGCXP38435 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGCXP38435 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGCXP38435 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GGCXP38435 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGCXP38435 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGCXP38435 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms