Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHRNA7P36544 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms