Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT20P35900 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT20P35900 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT20P35900 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT20P35900 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT20P35900 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT20P35900 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT20P35900 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT20P35900 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT20P35900 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT20P35900 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT20P35900 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT20P35900 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT20P35900 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT20P35900 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT20P35900 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT20P35900 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT20P35900 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT20P35900 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT20P35900 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT20P35900 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT20P35900 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT20P35900 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT20P35900 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT20P35900 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT20P35900 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT20P35900 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT20P35900 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT20P35900 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT20P35900 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT20P35900 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT20P35900 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT20P35900 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT20P35900 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT20P35900 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT20P35900 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT20P35900 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT20P35900 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT20P35900 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT20P35900 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT20P35900 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT20P35900 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT20P35900 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT20P35900 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT20P35900 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT20P35900 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT20P35900 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT20P35900 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT20P35900 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT20P35900 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT20P35900 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT20P35900 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT20P35900 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT20P35900 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT20P35900 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT20P35900 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT20P35900 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT20P35900 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT20P35900 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT20P35900 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT20P35900 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT20P35900 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT20P35900 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT20P35900 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT20P35900 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT20P35900 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms