Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HNF1BP35680 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HNF1BP35680 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HNF1BP35680 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms