Protein–RNA interactions for Protein: P35613

BSG, Basigin, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSGP35613 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSGP35613 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSGP35613 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSGP35613 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSGP35613 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSGP35613 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSGP35613 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSGP35613 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSGP35613 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSGP35613 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSGP35613 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSGP35613 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSGP35613 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSGP35613 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSGP35613 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSGP35613 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSGP35613 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSGP35613 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSGP35613 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSGP35613 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSGP35613 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSGP35613 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSGP35613 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSGP35613 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSGP35613 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSGP35613 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSGP35613 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSGP35613 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSGP35613 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSGP35613 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSGP35613 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSGP35613 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSGP35613 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BSGP35613 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSGP35613 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSGP35613 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSGP35613 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSGP35613 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSGP35613 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSGP35613 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSGP35613 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSGP35613 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSGP35613 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSGP35613 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSGP35613 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSGP35613 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSGP35613 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSGP35613 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSGP35613 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSGP35613 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSGP35613 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSGP35613 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSGP35613 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSGP35613 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSGP35613 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSGP35613 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSGP35613 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSGP35613 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSGP35613 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSGP35613 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSGP35613 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSGP35613 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSGP35613 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BSGP35613 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BSGP35613 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BSGP35613 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BSGP35613 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BSGP35613 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BSGP35613 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSGP35613 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSGP35613 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSGP35613 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSGP35613 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSGP35613 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSGP35613 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSGP35613 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSGP35613 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BSGP35613 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms