Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK1P35558 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK1P35558 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCK1P35558 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCK1P35558 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCK1P35558 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCK1P35558 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCK1P35558 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCK1P35558 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCK1P35558 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCK1P35558 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCK1P35558 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCK1P35558 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCK1P35558 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCK1P35558 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCK1P35558 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCK1P35558 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCK1P35558 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCK1P35558 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCK1P35558 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCK1P35558 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCK1P35558 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCK1P35558 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCK1P35558 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCK1P35558 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCK1P35558 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCK1P35558 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCK1P35558 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCK1P35558 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCK1P35558 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCK1P35558 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCK1P35558 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCK1P35558 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCK1P35558 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCK1P35558 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCK1P35558 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCK1P35558 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCK1P35558 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCK1P35558 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCK1P35558 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCK1P35558 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCK1P35558 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCK1P35558 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCK1P35558 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCK1P35558 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK1P35558 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK1P35558 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK1P35558 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK1P35558 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK1P35558 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK1P35558 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK1P35558 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK1P35558 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK1P35558 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK1P35558 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCK1P35558 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCK1P35558 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCK1P35558 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCK1P35558 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCK1P35558 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCK1P35558 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCK1P35558 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCK1P35558 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCK1P35558 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCK1P35558 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCK1P35558 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCK1P35558 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCK1P35558 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCK1P35558 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCK1P35558 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCK1P35558 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCK1P35558 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCK1P35558 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCK1P35558 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCK1P35558 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCK1P35558 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCK1P35558 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCK1P35558 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCK1P35558 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCK1P35558 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCK1P35558 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCK1P35558 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCK1P35558 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCK1P35558 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCK1P35558 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCK1P35558 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCK1P35558 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCK1P35558 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms