Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC1P35251 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC1P35251 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC1P35251 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFC1P35251 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFC1P35251 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFC1P35251 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC1P35251 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC1P35251 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC1P35251 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC1P35251 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC1P35251 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC1P35251 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC1P35251 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC1P35251 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC1P35251 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC1P35251 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC1P35251 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC1P35251 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC1P35251 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC1P35251 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC1P35251 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC1P35251 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC1P35251 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC1P35251 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC1P35251 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC1P35251 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC1P35251 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC1P35251 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC1P35251 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC1P35251 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC1P35251 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC1P35251 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC1P35251 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC1P35251 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC1P35251 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC1P35251 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC1P35251 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC1P35251 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC1P35251 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC1P35251 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC1P35251 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC1P35251 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC1P35251 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC1P35251 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC1P35251 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC1P35251 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC1P35251 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC1P35251 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFC1P35251 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC1P35251 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC1P35251 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC1P35251 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC1P35251 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC1P35251 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC1P35251 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFC1P35251 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC1P35251 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC1P35251 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC1P35251 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC1P35251 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFC1P35251 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC1P35251 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC1P35251 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFC1P35251 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC1P35251 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC1P35251 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC1P35251 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC1P35251 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC1P35251 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC1P35251 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC1P35251 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC1P35251 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFC1P35251 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC1P35251 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC1P35251 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC1P35251 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC1P35251 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC1P35251 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFC1P35251 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC1P35251 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC1P35251 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC1P35251 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC1P35251 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC1P35251 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFC1P35251 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC1P35251 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC1P35251 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC1P35251 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC1P35251 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFC1P35251 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC1P35251 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC1P35251 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC1P35251 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC1P35251 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC1P35251 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC1P35251 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC1P35251 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC1P35251 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC1P35251 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms