Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A1P32418 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC8A1P32418 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A1P32418 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms