Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA3P32297 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA3P32297 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA3P32297 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms