Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX1P32242 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX1P32242 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX1P32242 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX1P32242 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTX1P32242 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX1P32242 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX1P32242 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX1P32242 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX1P32242 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX1P32242 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX1P32242 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX1P32242 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX1P32242 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX1P32242 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX1P32242 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTX1P32242 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX1P32242 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX1P32242 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX1P32242 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX1P32242 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX1P32242 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX1P32242 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX1P32242 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX1P32242 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OTX1P32242 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX1P32242 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX1P32242 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX1P32242 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX1P32242 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX1P32242 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX1P32242 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX1P32242 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX1P32242 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OTX1P32242 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OTX1P32242 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OTX1P32242 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX1P32242 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX1P32242 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX1P32242 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX1P32242 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX1P32242 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX1P32242 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX1P32242 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX1P32242 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTX1P32242 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX1P32242 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX1P32242 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX1P32242 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX1P32242 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX1P32242 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX1P32242 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX1P32242 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX1P32242 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX1P32242 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX1P32242 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTX1P32242 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX1P32242 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX1P32242 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX1P32242 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX1P32242 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX1P32242 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX1P32242 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTX1P32242 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX1P32242 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX1P32242 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX1P32242 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX1P32242 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX1P32242 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX1P32242 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX1P32242 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX1P32242 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX1P32242 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTX1P32242 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTX1P32242 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTX1P32242 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTX1P32242 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX1P32242 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX1P32242 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX1P32242 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX1P32242 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX1P32242 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX1P32242 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX1P32242 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX1P32242 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX1P32242 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX1P32242 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTX1P32242 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms