Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCKBRP32239 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCKBRP32239 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCKBRP32239 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms