Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRM2P31350 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRM2P31350 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRM2P31350 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRM2P31350 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRM2P31350 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRM2P31350 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRM2P31350 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRM2P31350 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRM2P31350 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRM2P31350 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRM2P31350 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRM2P31350 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRM2P31350 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRM2P31350 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRM2P31350 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRM2P31350 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRM2P31350 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRM2P31350 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRM2P31350 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRM2P31350 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRM2P31350 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRM2P31350 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRM2P31350 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRM2P31350 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRM2P31350 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRM2P31350 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRM2P31350 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRM2P31350 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRM2P31350 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRM2P31350 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRM2P31350 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRM2P31350 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRM2P31350 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRM2P31350 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RRM2P31350 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRM2P31350 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRM2P31350 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRM2P31350 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRM2P31350 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRM2P31350 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRM2P31350 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RRM2P31350 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRM2P31350 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRM2P31350 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRM2P31350 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RRM2P31350 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRM2P31350 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRM2P31350 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRM2P31350 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRM2P31350 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRM2P31350 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRM2P31350 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRM2P31350 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRM2P31350 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRM2P31350 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRM2P31350 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRM2P31350 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RRM2P31350 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRM2P31350 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRM2P31350 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRM2P31350 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRM2P31350 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRM2P31350 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRM2P31350 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRM2P31350 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRM2P31350 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRM2P31350 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRM2P31350 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRM2P31350 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RRM2P31350 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms