Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXA7P31268 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA7P31268 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA7P31268 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms