Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABRR2P28476 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GABRR2P28476 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR2P28476 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR2P28476 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR2P28476 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR2P28476 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR2P28476 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR2P28476 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRR2P28476 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRR2P28476 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRR2P28476 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms