Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CD27P26842 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD27P26842 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD27P26842 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD27P26842 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD27P26842 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD27P26842 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD27P26842 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD27P26842 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD27P26842 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD27P26842 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD27P26842 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD27P26842 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD27P26842 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD27P26842 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD27P26842 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CD27P26842 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD27P26842 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD27P26842 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD27P26842 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD27P26842 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD27P26842 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD27P26842 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD27P26842 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD27P26842 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD27P26842 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD27P26842 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD27P26842 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD27P26842 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD27P26842 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD27P26842 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD27P26842 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD27P26842 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD27P26842 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD27P26842 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD27P26842 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD27P26842 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD27P26842 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD27P26842 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD27P26842 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD27P26842 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD27P26842 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD27P26842 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD27P26842 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD27P26842 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD27P26842 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD27P26842 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD27P26842 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD27P26842 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD27P26842 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD27P26842 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD27P26842 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD27P26842 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD27P26842 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD27P26842 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD27P26842 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD27P26842 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD27P26842 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD27P26842 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD27P26842 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD27P26842 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD27P26842 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD27P26842 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD27P26842 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD27P26842 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD27P26842 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD27P26842 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD27P26842 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD27P26842 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD27P26842 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD27P26842 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD27P26842 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD27P26842 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD27P26842 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD27P26842 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD27P26842 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD27P26842 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD27P26842 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD27P26842 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD27P26842 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD27P26842 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD27P26842 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD27P26842 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD27P26842 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD27P26842 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD27P26842 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CD27P26842 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD27P26842 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD27P26842 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD27P26842 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD27P26842 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD27P26842 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD27P26842 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD27P26842 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD27P26842 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD27P26842 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD27P26842 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD27P26842 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD27P26842 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD27P26842 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms