Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMA1P25391 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LAMA1P25391 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMA1P25391 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMA1P25391 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms