Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3P25205 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3P25205 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3P25205 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3P25205 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM3P25205 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM3P25205 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM3P25205 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM3P25205 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3P25205 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3P25205 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3P25205 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3P25205 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3P25205 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3P25205 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3P25205 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3P25205 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3P25205 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3P25205 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3P25205 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3P25205 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3P25205 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3P25205 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3P25205 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3P25205 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3P25205 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3P25205 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCM3P25205 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM3P25205 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM3P25205 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM3P25205 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM3P25205 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM3P25205 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM3P25205 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCM3P25205 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM3P25205 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM3P25205 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM3P25205 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM3P25205 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM3P25205 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM3P25205 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM3P25205 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCM3P25205 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM3P25205 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM3P25205 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM3P25205 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM3P25205 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM3P25205 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM3P25205 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM3P25205 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM3P25205 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCM3P25205 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCM3P25205 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCM3P25205 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM3P25205 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM3P25205 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM3P25205 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM3P25205 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM3P25205 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM3P25205 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM3P25205 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM3P25205 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCM3P25205 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM3P25205 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM3P25205 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM3P25205 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM3P25205 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM3P25205 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM3P25205 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCM3P25205 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM3P25205 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM3P25205 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM3P25205 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM3P25205 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM3P25205 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM3P25205 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM3P25205 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM3P25205 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM3P25205 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM3P25205 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCM3P25205 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM3P25205 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM3P25205 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM3P25205 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM3P25205 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM3P25205 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM3P25205 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM3P25205 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCM3P25205 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms