Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A2P23975 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC6A2P23975 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC6A2P23975 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms