Protein–RNA interactions for Protein: P23677

ITPKA, Inositol-trisphosphate 3-kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPKAP23677 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITPKAP23677 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITPKAP23677 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITPKAP23677 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITPKAP23677 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms