Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HRCP23327 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HRCP23327 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
HRCP23327 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
HRCP23327 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
HRCP23327 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
HRCP23327 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HRCP23327 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HRCP23327 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HRCP23327 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HRCP23327 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HRCP23327 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HRCP23327 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HRCP23327 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
HRCP23327 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
HRCP23327 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HRCP23327 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
HRCP23327 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
HRCP23327 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
HRCP23327 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HRCP23327 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
HRCP23327 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HRCP23327 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HRCP23327 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HRCP23327 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.95■■■■□ 3.34
HRCP23327 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
HRCP23327 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HRCP23327 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HRCP23327 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HRCP23327 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HRCP23327 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
HRCP23327 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HRCP23327 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HRCP23327 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HRCP23327 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
HRCP23327 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HRCP23327 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HRCP23327 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
HRCP23327 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HRCP23327 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HRCP23327 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HRCP23327 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HRCP23327 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
HRCP23327 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HRCP23327 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HRCP23327 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HRCP23327 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
HRCP23327 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HRCP23327 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HRCP23327 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HRCP23327 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HRCP23327 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
HRCP23327 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HRCP23327 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HRCP23327 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
HRCP23327 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HRCP23327 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HRCP23327 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HRCP23327 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.34
HRCP23327 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HRCP23327 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HRCP23327 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HRCP23327 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HRCP23327 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
HRCP23327 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HRCP23327 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HRCP23327 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
HRCP23327 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HRCP23327 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HRCP23327 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HRCP23327 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HRCP23327 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HRCP23327 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HRCP23327 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HRCP23327 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HRCP23327 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HRCP23327 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HRCP23327 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HRCP23327 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HRCP23327 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HRCP23327 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HRCP23327 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HRCP23327 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HRCP23327 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HRCP23327 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HRCP23327 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
HRCP23327 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms