Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP1P17987 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP1P17987 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP1P17987 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP1P17987 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP1P17987 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP1P17987 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCP1P17987 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCP1P17987 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCP1P17987 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP1P17987 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP1P17987 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP1P17987 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP1P17987 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP1P17987 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP1P17987 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP1P17987 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP1P17987 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP1P17987 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP1P17987 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP1P17987 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP1P17987 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP1P17987 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP1P17987 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP1P17987 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP1P17987 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP1P17987 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCP1P17987 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCP1P17987 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCP1P17987 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCP1P17987 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCP1P17987 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCP1P17987 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCP1P17987 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCP1P17987 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCP1P17987 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCP1P17987 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCP1P17987 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCP1P17987 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCP1P17987 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCP1P17987 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCP1P17987 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCP1P17987 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCP1P17987 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCP1P17987 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCP1P17987 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCP1P17987 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCP1P17987 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCP1P17987 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCP1P17987 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCP1P17987 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCP1P17987 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCP1P17987 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP1P17987 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP1P17987 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP1P17987 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP1P17987 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP1P17987 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP1P17987 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP1P17987 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP1P17987 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP1P17987 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP1P17987 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP1P17987 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP1P17987 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP1P17987 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP1P17987 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP1P17987 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP1P17987 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP1P17987 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP1P17987 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP1P17987 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP1P17987 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP1P17987 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP1P17987 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP1P17987 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms