Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHRNB2P17787 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHRNB2P17787 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms