Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
VEGFAP15692 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
VEGFAP15692 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VEGFAP15692 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms