Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPA3P15088 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA3P15088 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA3P15088 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA3P15088 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA3P15088 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA3P15088 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA3P15088 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA3P15088 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPA3P15088 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA3P15088 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA3P15088 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA3P15088 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA3P15088 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA3P15088 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPA3P15088 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA3P15088 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA3P15088 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA3P15088 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA3P15088 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA3P15088 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPA3P15088 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA3P15088 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA3P15088 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA3P15088 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPA3P15088 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPA3P15088 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPA3P15088 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA3P15088 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA3P15088 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA3P15088 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA3P15088 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA3P15088 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA3P15088 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPA3P15088 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA3P15088 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA3P15088 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA3P15088 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA3P15088 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA3P15088 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA3P15088 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA3P15088 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA3P15088 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPA3P15088 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA3P15088 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA3P15088 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA3P15088 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA3P15088 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA3P15088 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA3P15088 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA3P15088 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA3P15088 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA3P15088 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPA3P15088 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA3P15088 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA3P15088 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA3P15088 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA3P15088 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA3P15088 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA3P15088 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA3P15088 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPA3P15088 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA3P15088 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA3P15088 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA3P15088 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA3P15088 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA3P15088 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA3P15088 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA3P15088 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA3P15088 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA3P15088 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA3P15088 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA3P15088 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA3P15088 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA3P15088 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA3P15088 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA3P15088 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA3P15088 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA3P15088 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA3P15088 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA3P15088 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA3P15088 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA3P15088 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA3P15088 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA3P15088 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA3P15088 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA3P15088 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA3P15088 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA3P15088 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA3P15088 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA3P15088 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA3P15088 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA3P15088 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA3P15088 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA3P15088 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA3P15088 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA3P15088 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA3P15088 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA3P15088 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA3P15088 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms