Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXB3P14651 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB3P14651 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms